现有任天堂Switch型号使用的microSD卡将无法兼容Switch 2，新一代主机仅支持microSD Express规格存储。
若将普通microSD卡插入Switch 2，仅能查看截图和视频，已安装游戏、DLC内容和存档数据均无法访问。
即将发布的Switch 2虽配备支持HDR和120Hz刷新率的屏幕，并具备4K坞站模式，但存储卡兼容性的改变可能令用户失望。尽管新主机可以读取旧规格存储卡，但仅支持microSD Express卡用于游戏相关功能。
当前Switch全系机型（初代/Lite/OLED版）支持最大2TB的microSDXC卡，而Switch 2必须使用标有 microSD EX 或 microSD Express 的专用存储卡。
任天堂表示可通过主机间数据传输功能迁移存档，但需要同时持有新旧两台设备。这对计划以旧换新的玩家形成阻碍 除非订阅任天堂Switch Online云存档服务，否则将永久丢失本地存档。
价格方面，microSD Express卡较传统存储卡显著更贵。任天堂确认将授权三星等品牌生产专用存储卡，同时也支持第三方合格产品。